今のHPCで行われるほとんどの計算ではメモリとインターコネクトの帯域が足かせになってるんだから、
FPGAにより面倒な計算が一発で終わるので速くなる用途は限定されると思うんですが

それこそ初期のGRAPEみたいな感じなら速くなるだろうけど