連続で失礼、一応報告をば
ViXというソフトでコマンドライン起動でいろいろ確認してみた
　コマンドA:"/root z:\"　起動時のルートをz:\にする
　コマンドB:"/minimize"　前回起動状態を無視して最小化起動する

　1.「ランチャ」に"ViX"をAまたはBのパラメータで登録
　2.A,Bともにメニュー、ボタン起動でOK
　3.cmd2で"ViX"をTabで実行、A,Bどちらも反映されないで通常起動
　4.「コマンド」に"ViX"を登録
　5."ViX /root z:\"、"ViX /minimize"をTabで実行、両方OK

IronPortableがうまく起動しないのと、ランチャアイテムを扱うのは別問題のようだ
ちなみにIronPortableのパラメータを一つにしたがダメだった
IronPortable特有の問題なら妥協してもいいかもしれない