データ消えるとかそんなもんリカバリーする時の設定によるわ
リカバリーすらしたことない知ったか乙
ちなみにデータが読み込めないほどHDDが壊れそうな時は「○○が見つかりません」なんて丁寧なエラーは大抵出ない
普通にファイルが見つからないだけ　それがデフラグのせいかどうかはしらんが

あと○○ってのはなに？OSのファイル？それぞれのソフトのDLL？
それによっては対処の仕方が変わってくるよ