原因らしきものがわかりました。システム辞書が巨大過ぎたようです。なんと
システム辞書のokuri-ari変換が動いていなかった。不具合に気付かなかったのは
(1) ibus は ZOOM会議にしか使っていない。（他ではuim）
(2) ユーザ辞書でそこそこ変換できていた。
という事によります。システム辞書を辞書サーバー経由にしたら正常化しました。

実は辞書サーバーも、候補が多すぎるときには全部を扱えない不具合があったのを
ソースコードにある定数を変更して動かせるようにした、という事がありました。