Windows7 Pro SP1 64ビット上で、DupFileEliminator 20140223を実行。
対象ファイルは17700、結果は205グループ、410ファイルくらい。

「フォルダ名でのソート」を2回したら、異常終了しました。
ダイアログに表示された情報は、以下の通りです。

問題の署名:
問題イベント名: CLR20r3
問題の署名 01: dupfileeliminator.exe
問題の署名 02: 1.0.0.0
問題の署名 03: 5309e591
問題の署名 04: WindowsBase
問題の署名 05: 4.0.30319.18408
問題の署名 06: 52313189
問題の署名 07: 7be
問題の署名 08: 7
問題の署名 09: System.InvalidOperationException
OS バージョン: 6.1.7601.2.1.0.256.48
ロケール ID: 1041
追加情報 1: fb73
追加情報 2: fb73ab56b22020cb68a0b2b7cb2e9876
追加情報 3: e174
追加情報 4: e1747685853eb27f3d5b2dc03939fcde