一旦 uLilith で Wave ファイルに変換して波形エディタで見てみ？
おそらく正常な内容になっていて、その Wave ファイルを uLilith　で再生しても、やっぱりおかしくなるぞ、きっと。
そしたらあなたのデバイスがおかしい。
そもそも他のソフトは大丈夫って、Wasapi だの Asio だの、条件揃えて再生してみてるの？
uLilith で選んでる出力方法に対して、ドライバに不具合があるだけじゃないの？
uLilith 側の設定変えてみ？