ダウンロードタブのツリーで右クリック→追加からブックマーク追加画面を開き、
「登録時に設定する保存場所」を[…]ボタンから設定すると
デフォルトでこのソフトのインストールされたディレクトリ(多分pwd)が開いていますが、
これをデフォルトの保存パスが開くようにできませんか？

デフォルト保存パス下にリストごとのサブフォルダを作りたい場合、いちいちデフォルト保存場所に行くのが地味に面倒なもので
[作]ボタンから直でデフォルト保存パス下にサブフォルダ作れるとなお便利ですが挙動が混乱しそうですね