>>923
また、そもそも、そちら様の環境で、どのような挙動が起きているのか、当方には、把握できておりません

たとえば、「もともと使ってた方」のNicomentXenoglossia.exeに、https://ch.nicovideo.jp/syu_capu/video を登録した場合、

(1)初回は、リストに「[1538626262]終電後､カプセルホテルで､上司に微熱伝わる夜｡ 　第1話」と登録されて、
　ダウンロードを実行すると、リストの表示は「[1538626262]終電後､カプセルホテルで､上司に微熱伝わる夜｡ 　第1話」のままで、
　「[1538626262]終電後､カプセルホテルで､上司に微熱伝わる夜｡ 　第1話.mp4」というファイルが保存される

(2)その状態からもう１回ダウンロードを実行すると、
　リストの表示が「[1538626262]終電後､カプセルホテルで､上司に微熱伝わる夜｡ 　第1話」から
　「[so33963361]終電後､カプセルホテルで､上司に微熱伝わる夜｡ 　第1話」に変わって、
　「[so33963361]終電後､カプセルホテルで､上司に微熱伝わる夜｡ 　第1話.mp4」というファイルが保存される

……という流れで、「[1538626262]終電後､カプセルホテルで､上司に微熱伝わる夜｡ 　第1話.mp4」と、
「[so33963361]終電後､カプセルホテルで､上司に微熱伝わる夜｡ 　第1話.mp4」の、ふたつのファイルが
残るという経緯なのでしょうか？

それとも、2回目のダウンロードで、「[1538626262]終電後､カプセルホテルで､上司に微熱伝わる夜｡ 　第1話.mp4」が、
「[so33963361]終電後､カプセルホテルで､上司に微熱伝わる夜｡ 　第1話.mp4」にリネームされるのでしょうか？

まことに恐れ入りますが、こちらには、具体的なことが伝わってきておりませんので、
(1)や(2)は上記の通りなのか、違うところがあるのか、各段階で実際に保存されたファイル名を確認しているのか、
順を追って、具体的に、説明していただけましたら幸いです