http://www.hcn.zaq.ne.jp/___/unix/sox-ja.html#E-silence
http://www.hcn.zaq.ne.jp/___/unix/sox-ja.html#E-pad
これを参考にSoXでスタジオ録音CDソースの場合の一律両端無音自動カット、一律末尾1秒無音添加をお試し中なのですが
sox in.wav temp.wav silence 1 1 -60d reverse silence 1 1 -60d reverse pad 0 1.00
sox in.wav temp.wav silence 1 1 -60d reverse silence 1 1 -60d reverse pad >1s< 1.00

1サンプルでも先頭に無音付け加えた後者のほうがいいでしょうか？
なにか危険なことしていれば教えてもらえませんか