mesen以外のNESコアなら７年前のi3ノートを性能50％まで落としても余裕で動く
問題があるなら設定

俺の場合は>>965で改善したけどな
遅延オプションのフレームの遅れを上げすぎてるんじゃないの？
retroarch.cfgをどっかに移しておいて設定最初からやり直してみれば？