俺もインタレ解除がうまく出来てない時あったな
いつの間にか直ってたから原因はわからんｗ
インタレ解除だけならpowerDVDのデコーダが優秀なんだけど
madVRとは同時に使えないんだっけ

あと思い付くのは動画のハードウェアデコード止めてソフトウェアでやるとか
madVRの設定をギリギリdropしないラインにしてるなら余裕持たせてみるとか