元のバージョンに戻してからステートロードで使えるはず
その後ゲーム内で普通にセーブしてからバージョンアップすればいい

Dolphinに限らずステートセーブっていうのは
基本的にはバージョンが変わると互換性が無い物
例外的にバージョン間のソフトウェアの違いがそれほど大きくない場合は使える場合もある