>>538 が
＞4.00にしたら自動起動が消えた（もちろん登録してた自動起動項目も機能せず）

と書いているが、
自分は Ver4.00 にしてから、自動起動も含めて動いていたが
ClHook.dll がウイルス扱いになりClaunch自体が起動しなくなり、
この dll をウイルスではないとして許可したら、
Claunchは起動するが自動起動に登録したものだけ起動しなくなった。自動起動の登録は消えていない。

4.01にアップデートしてダメなら、
3.29に戻してみる