http://gimpforums.com/thread-default-export-image-settings-not-saved-in-gimp-2-8

ここの#2に答えが書かれていました。
Save Defaultsで保存した品質をQsav、
開いた画像のjpeg圧縮率をQpicとすると

exportにおける品質のデフォルト値は max( Qsav, Qpic ) になる

ということのようです。
なのでSave Defaultsで50等の低い値で試してみてください。>>596