相対参照の ../ はTFで使えないんだよね
フルパス　%PATH%
ファイル名　%filename%
フォルダ名　%directory% または $directory(%PATH%)
その親フォルダ名　$directory(%PATH%,2)
そのまた親フォルダ名　$directory(%PATH%,3)

C:\HOGE\$directory(%PATH%,3)\$directory(%PATH%,2)\%directory%\%filename%
から単純にひとつ上なら、foobar2000 の Move to で

Dest. folder:　C:\HOGE\
File name:　　$directory(%PATH%,3)\$directory(%PATH%,2)\%filename%
または　　　　$directory(%PATH%,2)\%directory%\%filename%

$directory(%PATH%,3)\ や $directory(%PATH%,2)\ や %directory%\ の部分にTFで
%genre%\%artist%\ とか %album%\[DISC%discnumber%\] とかで階層を自由に増減できる