>>844
コマンドラインオプションで操作するのなら
メニューコマンドになっている必要があると思う

これでどうだろう?

1. JScript Panel のv1.2.2以降を使用 (スクリプトのメインメニューコマンド化ができるようになっている)
2. 以下のスクリプトを記述

function on_main_menu (index) {
switch (index) {
case 1: //メインメニュー"File/Jscript Panel/1"(Shift + "File"で表示)で実行
fb.StopAfterCurrent = false; //Stop after current をオフにする
fb.Play(); //再生する → ここはコマンドラインオプションで操作してもいいかも
break;
}
}

3. コマンドラインに foobar2000.exe "/command:1" を指定

ただし、起動時コマンドラインオプションが実行されるタイミングが
UI初期化後(JScript Panelの初期化後)であることが前提だけど… (何度か試したかぎりでは大丈夫そう)