Cドライブ SSD
Dドライブ HDD
という構成なのですが、今回DドライブのHDDが壊れそうなので換装したいです

そこで、新HDDをEドライブとして接続してクローンしようと思うのですが、この場合windowsのファイルシステムやインストール済みのソフトウェアは壊れたりしませんかね？

SSDの容量が少ないので、マイドキュメントやソフトはHDDにインストールしていました