朗報です。

途切れたり、途絶えたりするようになったffmpegに代わり、完全な
ダウンロードを可能とする、youtube-dlによるradiko.jpのコマンド、
下記参照。

youtube-dl --hls-prefer-native --add-header X-Radiko-AuthToken:文字列 "https://radiko.jp/～/playlist.m3u8?station_id=～"

尚、X-Radiko-AuthToken:文字列 はffmpegとは異なり、":"の次にスペース
を置かないこと。youtube-dlは最新のものを使用する。