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gpg --cipher-algo CAMELLIA256 -c --passphrase パスワード１ < 暗号対象のファイル | gpg -c --passphrase パスワード２ > 暗号化ファイル
CAMELLIAでパスワード１で暗号化してから、AESでパスワード２で暗号化する例。
Linuxだと上でいけるはず。