>>221
バックアップから上書きできるのは
theme.fth
libraryフォルダ
playlists-v1.3フォルダ
user-componentsフォルダ
configurationフォルダ

Preferencesウインドウの設定項目のほとんどは configuration\core.cfg にまとめて格納されているので
最低限の設定だけの移植はむずかしいとおもう
各コンポーネントごとで設定をエクスポートしていなかったのなら「最低限の」っていうのは無理かも
ポータブルモードで別フォルダにインストールしたfb2kを同時起動して設定内容を見比べるしかない

インストーラのハッシュを確認するとかHDDにチェックディスクをかけるとか
再生方法を制御するコンポーネントやDSP、メモリバッファ、再生カウント、レーティングなどにからんでいる設定があるなら見直すとか
Visualizationsの使用をやめるとか

あとはレジストリキー
[HKEY_CLASSES_ROOT\foobar2000.AAC]〜[HKEY_CLASSES_ROOT\foobar2000.WV]
[HKEY_LOCAL_MACHINE\SOFTWARE\Microsoft\Windows\CurrentVersion\App Paths\foobar2000]
の中を調べてfoobar2000のパスやコマンドライン、引数が正しく記述されているか確認