f2kには直接は関係ないかもしれないけど、f2kきっかけでハマったトラブルの解消法をなにかの参考になるかもしれないので情報として残しておきます

.dat(コマンドプロンプト)のSTARTコマンドで
"フルパス.foober2000.exe"で起動させようとすると、foobar2000名義のdos窓が出るだけでf2kが起動しない
カレントフォルダを移動させたり、管理者権限で起動しても変わらず
問題切り分けの為NotepadとMPC-BEでも試してみると、ノートパットは起動(構文間違いはないことが確認できた)、MPCはf2k同様にdos窓が出る始末(謎)
考えうる色々な手段に出るも解消しないので3時間ほど悩んでコマンドプロンプト関連の検索結果でヒント発見

START "" "フルパス"で普通に起動した
(フルパスの前に""(ダブルコーテーション2丁で空撃ちをする)
起動が遅いソフトなどを起動させるとdos窓出ちゃうような時に使えるっぽい

以上チラ裏でした