ポータブル版つかってるがccleaner.iniに
CustomLocation1=FIREFOX|C:\Users\ユーザー名\AppData\Local\Waterfox\Profiles\プロファイルフォルダ
CustomLocation2=FIREFOX|C:\Users\ユーザー名\AppData\Roaming\Waterfox\Profiles\プロファイルフォルダ
追加でいけてるっぽい
ツール→ブラウザプラグインのfirefoxのプロダクトってとこ見たらWaterfoxって出てるからたぶん認識されてるとおもう