>>698の件です
作業時間が取れなくて返答が遅くなりすいません
回答レスを全体見てたまたま>>702のBonTsDemuxを持ってたので使ってみたところ
分離時に必要な主音声だけwavで取り出せたので
無音映像を取り込んだ後に音声追加をしたところ
やっと音声付のmp4が作れました・・・これで編集エンコできます
この先もたぶん同様なことがあればこれでできたらいいなと
回答してくれた他のみなさんもありがとうございました