一応、Padieというソフトで複数の画像を一括減色できました
（jpgを減色するためにはSusieプラグインが必要でしたが）

設定の際、1ビット（2色）・ディザ方法を「弱」にすることでなんとなくそれっぽい2色画像にはなったものの
カラーコードを直接指定しているわけではないので、背景の白っぽい部分も白として認識されてしまいます…

ということで引き続き>>719に挙げたようなソフトを探しています