設定->あぼーん->Option の
「NGをあぼ〜ん(NGワードを削除しても復活しない)」が有効になってた(なってる)んじゃね?

そうであれば&「そのスレ」の自分/重要/あぼーんのフラグが初期化されても良いのであれば
板の名前とカテゴリの名前とスレのURL(>>4のD)をメモ帳にでもコピペで記録して、
Jane Styleを終了してからJane Styleのログがあるフォルダからabnファイルを削除する
例えばこのスレであれば
カテゴリ: PC等
板名: ソフトウェア
URL: https://egg.5ch.net/test/read.cgi/software/1535090252/
なので、
Jane Style\Logs\2ch\PC等\ソフトウェア
フォルダから "1535090252.abn" ファイルを取り除くと(別の場所へ移動が良い)
このスレのフラグ設定(自分/重要/あぼーん)が初期化される