Threema --- 「有料」、スイス企業、アカウントに電話番号やメールアドレスを使用しない
       デスクトップ版が無い 強制E2E通信 第三者機関による監査済

Wickr --- アカウントに電話番号やメールアドレスを使用しない、第三者機関による監査済
     PFS(パーフェクトフォワードセキュリティ)、NSAによるお墨付き(これはお墨付きと言うのだろうかw)

Wire --- Skype創業者とその残党が新しく作ったメッセンジャー E2Eの実装はWhatsappと同じ2016年で、
     同じくSignalプロトコルを使用している(Wireの場合はそこから更にカスタマイズした「Proteus」プロトコル)
     

上記3つは俺は試してないので悪しからず 気になった情報だけまとめといた
まあどれも概ね大丈夫そうだが、Wickrは色々見てるとアメリカの公的機関(例えばNSAとか軍とか)と関わってる感がわりとあるので
NSAアレルギーの人は使用しないほうがいいのだろう