「設定をしようとしても反応しない」ってのがどのレベルなのか？

使ってないから分からないけど
SyncSNE自体が反応しないんだったら
サイトに書いてるようにセキュリティソフトで除外する

SNXとの連携が取れないんだったら連携タブの
チェックボックス「version 1.0.5.0」でSNXのバージョンに合わせる

最新SNXは1.4.0.0だから、それだったらチェックを外す
1.0.5.0以前だったらチェックをつけるでいいんだと思う