音楽ファイルの変換についてです。

Flac形式の音楽ファイルをqaacエンコーダを使って拡張子m4aのaac形式のファイルにエンコードしたく、
BatchEncoderというエンコーダのフロントエンドソフトを使って変換しましたが、Flacファイルに埋め込んであるタグ（曲名・アーティスト・アルバム・アートワーク等）がAACに引き継がれません。
理由としては、BatchEncoderのエンコードは、Flac→Wav→AACという流れで行っており、qaac.exeがFlacを直接読めないのでこうなっています。Wavフォーマットはタグを埋め込めないので、タグが引き継がれないわけです。

現在では仕方なしに、Mp3Tagと呼ばれるソフトを使ってタグ情報を移したりしていますが、タグ情報を引き継いでエンコードするツール等ありませんでしょうか。
OSはWindows10です。