エラーを見ただけだとファイルがありませんって事だから、エラーが出ないように500MB以上のファイルを一旦ローカルに退避して
同期エラーが出ないところまで持っていくことできる？

DBと実体ファイルの非同期で上手くいってない可能性とかあるかもしれないし・・・
で、エラーが出なくなってから強制同期して再度１つ500MB以上のファイルをアップしてエラーが出ないか確認