うろ覚えで申し訳ありませんが、自分も似たような経験があったので参考までに
①音声ファイルの「動画ファイルと連携」のチェック項目が関係している？
タイムラインでの表示名が「音声ファイル」ではなく、参照しているファイル名になっていると音が出る
②aviutl.iniというファイルに前回開いていた時の設定が保存されている

自分も質問させてください
テツ氏作のTrackingLine3Dというスクリプトのオプションに関する質問です
自分の環境では一部のスクリプトが作動しない状態なのですが、皆さんの環境では作動しているのでしょうか？
製作者の方とは連絡が取れなかったため、皆さんの意見をお聞かせ願えればと存じます
なお、動作しないオプションは下記の通りです

・3D重ねる
・ライン2
・点線

修正を試みたところ、点線オプションは修正することができました。
ですが、残り二つのオプションに関しては変わらず反映されません。
スクリプトの中身を見たところ、3D重ねるオプションが主な原因かと思われるのですが、自分の知識では解決できませんでした。

[補足]
3D重ねるオプションは設定してもライン自体が表示されない状態であるのに対し、ラインオプションは設定が反映されないものの、ラインの表示自体はされます
また、両方ともオプション数に関するエラー文は表示されません
添付画像は元ファイルと修正途中経過の比較です

https://dotup.org/uploda/dotup.org2264467.png.html