ストレージごとクローンしようとしている躓いている素人さんへのアドバイスです
リストアしようとしているストレージ内へと先頭のパーティションからひとつずつリストア作業をして行きます
この際に、リカバリーメディアでもOSのインストールメディアからでも構いませんので、コマンドプロンプトへと入って
diskpartからcleanコマンドをストレージへと発行後に、運用するブート方式によりストレージへとconvert MBRないしconvert GPTを実行します
もしも、起動不能へと陥った際には、bcdboot C:\Windows /l ja-JPを実行します
MBR形式のストレージの場合には、先頭からの認識順にドライブレターがPEから割り当てられますので、
D:\Windowsとして見えている場合には、bcdboot D:\Windows /l ja-JPを実行します
これで起動するようになります