BS11のロゴ変更前は、ロゴサンプル取得時は、すべてのフィルタを解除して収集、
ロゴ削除時は、自動フィールドシフト(VFではないもの)適用後にロゴ削除を行うようにいました。

>>951 さんの言うように、今までは自分は透過性ロゴ(改)を使用し
自動Fade機能を適用することでロゴがきれいに消えていました。
現状もBS11以外でこの方法を使用していて問題なくロゴを消せています。