AutoHotkey.ahk − a.ahk
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− b.ahk
[a.ahk]
a::Gui生成
GuiClose:終了処理
[b.ahk]
b::Gui生成

こんな感じの構成でそれぞれのGuiが別物の場合、bの方のGuiCloseを書くにはどうしたら?
2GuiCloseとかは2つGuiがShowされていたらの話だと思っていて、実際に動作しなかった。