皆さん検証と意見ありがとうございます。
お騒がせして申し訳有りません。

原因が判明しました。
Photoshop上でaltを押すとメニューバーにフォーカスがいってしまうのを防ぐために入れたスクリプトが原因かと思います。
*~Alt::Send {Blind}{vk07}
コイツを停止したらならなくなりました。
しかしaltのシングル押しは乱用するのでメニューバーにフォーカスがいってしまうのは防ぎたいです。
どうすれば良いでしょうか？