再掲

質問者が考えてる昔のファイルとは何か？
2回スキャンして1回目のスキャン結果だけを消したい
と考えられる

それは出来ないから
無理ですあきらめましょう
と書いてる
このどこが間違いなのか？

プレイリストを削除して再スキャンという答えは
プレイリストの管理での削除やスキャン設定時の上書きのオプションを知っているかどうか分からないので
まずは質問内容に対してストレートに答えただけ