HDDを複数台のPCに差し替えてデータ共有をしていたのですが、何度もHDDのデータ消失を体験しました。
現象はだいたいこんな感じです。HDDの差し替え前にはPCをシャットダウンしてからHDDをSATAあるいは
USBから取り外しています。

1. HDDを差し替えた直後フォーマットされてない状態になる
2. 差し替え前のPCにつなげるとファイルがある。
3. もう一回差し替えてもフォーマットされていない状態
4. 差し替え前のPCにつなげたらフォーマットされていない状態

いまWin10での高速スタートアップ有効ではないかと疑っていますが、どうでしょう?
Win10にする前(といってもずいぶん昔ですが)にはこんなことはなかったので。
ほかにも要因はあると思うのですが、同様の体験をされた方の設定はどうだったでしょうか。

なお復旧はEaseUS Data Recovery Wizard(購入済)でファイル7割程度、今日ここをみて他にいい
ツールがあることを知って愕然。読めないHDD3台残っているのでこれにはRecuvaを試してみます。