違います
ファイルシステムを認識している場合のクローンは、使用している領域になっているLBAアドレスの内容しか転送しません
反対にRAWパーティションとしてセクタバイセクタでクローンするのならばユーザー領域として使用可能なLBAアドレスをそのままの内容として転送します
このオプションを指定するかしないかによって変わってきます
あなたが言おうとしているのは、LBAアドレスを順に他のストレージ内へと全てそのままに転送するセクタバイセクタです
この場合には不良セクタが見付かるとエラーとなってクローン作業は失敗します