ssimでmkvを入力するとやたらめった低くなるのって既出？

ソース(origin.m2ts、BD、H.264)とソースを比較
ffmpeg -i origin.m2ts -i origin.m2ts -an -filter_complex ssim -f null -
当然結果は1.0(inf)

ソースをmp4にmuxしてタイムスタンプを合わせて比較
ffmpeg -i ref.m2ts -an -c:v copy copy.mp4
ffmpeg -i copy.mp4 -i origin.m2ts -an -lavfi "[0:v]settb=AVTB,setpts=PTS-STARTPTS[main];[1:v]settb=AVTB,setpts=PTS-STARTPTS[ref];[main][ref]ssim" -f null -
copyなので予想通り結果は1.0(inf)

ソースをmkvにmuxしてタイムスタンプを合わせて比較
ffmpeg -i origin.m2ts -an -c:v copy copy.mkv
ffmpeg -i copy.mkv -i origin.m2ts -an -lavfi "[0:v]settb=AVTB,setpts=PTS-STARTPTS[main];[1:v]settb=AVTB,setpts=PTS-STARTPTS[ref];[main][ref]ssim" -f null -
結果は
SSIM Y:0.922225 (11.091597) U:0.985489 (18.383000) V:0.989469 (19.775481) All:0.943976 (12.516286)
mkvmergeでm2tsをmkvにmuxしても全く同じ数値