プロテクトの種類による。

FDの物理特性を利用したプロテクトの場合は無理かも。

たとえば、あるセクタを磁気的に不安定にして、
読み込みのたびに値が変わることで、
正しいディスクと判断するプロテクトを施したとしよう。

こうなると、仮想化の前にプロテクトを外しておかないと、
原理的に無理。