>>543
最後にするとか言ったけどレス頂いたんでちょっとだけ

同じ不具合に悩んでる人がいて安心？した笑
自分でもあれから色々調べてみてたんですが強制字幕なら必ずバグるかと言うとそうでも無さそうで、どうやら字幕間の空白時間が長い字幕はバグっるって感じで間違い無さそうですね。
ただ具体的にどのくらい字幕に間があくとバグるかとかトリガーが謎なのと映画毎にそれを見分けるのは不可能そうなので、
とりあえず自分としては動画に組み込まずsrtファイルとして落として1映画を1フォルダにまとめて再生ソフトの方で外部の字幕ファイルを読ませるようにしました。
ffmpegとかで再度字幕組み込む作業も面倒だし、また今後も字幕に何かあった場合、外部ファイルに分けてたほうが差し替えも楽そうなので。

という事で543さんいう通り、どの映画の字幕がバグっててどの映画なら大丈夫なのかが、もはや判別不能なので落とし直しのできる映画は全部落とし直すコトにしました。
正直糞面倒ですが笑