ちょっとdumpしてみたけど、niconicome.db ってLiteDBだからC#で古いバージョンの niconicome.db -> JSON に出力するツールを作ればいいかも
本来なら設定やdbはなるべく互換性を持たせるように設計するのがセオリーだけど・・・まあそこまで求めちゃうのは酷な話か