以前の****.scssは互換のためにそのままcssとして読まれるのでcssとしての記述に問題がなければそのまま適用されます
ただし今後は****.cssも同じ場所にある時はそちらを優先し****.scssを読まなくなります

積極的に変更を行う場合は拡張子をcssに変更しておくのが無難です