外部ツールでDLした動画を読むめどはつきましたが、問題はファイル名です。
修正すると動画ファイル名がさきゅばすでつけてる命名規則と同じじゃないと「動画が読み込めません」で変換できません。
そこはみなさんで解決できるのでしょうか？

また、オフラインでの変換だと[so******]があれば変換できるので動画ファイルそのままでいいのですが、
おそらくコメントファイルはメインのxmlファイルしか読んでないと思います。それでいいのでしょうか？

いろいろ考えてみているのですが、どう考えても今よりずっと使いにくくなるしかないです。
特にこのツールはニコ動についてはＤＬ→変換が一体化してて切り離せないですね。