よく聞く問題ではある
HD振動が結構帯域使うみたいで振動を無効にすると改善することもあるとか
ただジョイコン使うゲームで振動なしにするのはあまりにも微妙だよね

Bluetooth(R) USBアダプター(Class2) - LBT-UAN05C2
https://www.elecom.co.jp/products/LBT-UAN05C2.html
うちではこれ使っててyuzuでEnable direct JoyCon driverオン、もちろん振動もオンで正常に使えてる
USBドングルなら物理的に近づけることも出来るから改善の可能性はあるだろうね
もちろん電波環境次第だけど