ブラウザの拡張機能のアイテムフィルター「フィルター：フォルダーなし」の検索が効かないのに気付いた。少し前までアイテムにフォルダー指定してないのはその検索にヒットしていたのに...
あと上記の症状調べているときに.csv形式のエクスポートはクレカのデータをバックアップしてないのに気付いた。.json形式は問題なく記録されていました。
スプレッドシートで直感的に見やすかったから.csvでバックアップしていたけど、今後は.jsonにすることにしました。