自分はまだ5にしてないけど4だと
HKEY_CURRENT_USER\SOFTWARE\Fanfare\Paintgraphic 4 Pro 64\Recent File List
にそのリストが入ってるからコマンドラインから
reg delete "HKEY_CURRENT_USER\SOFTWARE\Fanfare\Paintgraphic 4 Pro 64\Recent File List" /f
を実行すれば消えるよ
バッチファイルにしておけばクリック一発で消去出来る