ショートカットのリンク先
"C:\Program Files\Basilisk\basilisk.exe" -p
でプロファイル管理　ここで仮にbasilisk、serpentというプロファイルを作る
"C:\Program Files\Basilisk\basilisk.exe" -p basilisk
"C:\Program Files\Serpent\basilisk.exe" -p serpent
でそれぞれのプロファイルで起動
もし「既に起動しています」みたいなのが出てきたら後ろに-no-remoteを付ければ競合しないはず
（"C:\Program Files\Serpent\basilisk.exe" -p serpent -no-remote)

説明下手だったらすまん