その辺り、横からみててちと疑問だったんだけど
いきなり最新版インストーラを使った場合はレジストリ登録が上手く行かないってこと？
いったんSikiをアンインスコしてから、最新インストーラで別の任意のフォルダにインスコ…でいけそうな気もしてしまうんだが

あとこれはSiki固有の仕組みじゃなくてWinの基本仕様ってことなのかな